显示下一条 | 关闭 温馨提示！由于新浪微博认证机制调整，您的新浪微博帐号绑定已过期，请重新绑定！立即重新绑定新浪微博》 | 关闭 飘1、在NCBI上搜索到目的基因，找到该基因的mRNA，在CDS选项中，找到编码区所在位置，在下面的origin中，Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。2、用Primer Premier5搜索引物
①打开Primer Premier5，点击File-New-DNA sequence, 出现输入序列窗口，Copy目的序列在输入框内（选择As），此窗口内，序列也可以直接翻译成蛋白。点击Primer，进入引物窗口。
②此窗口可以链接到“引物搜索”、“引物编辑”以及“搜索结果”选项，点击Search按钮，进入引物搜索框，选择“PCR primers”，“Pairs”，设定搜索区域和引物长度和产物长度。在Search Parameters里面，可以设定相应参数。一般若无特殊需要，参数选择默认即可，但产物长度可以适当变化，因为100～200bp的产物电泳跑得较散，所以可以选择 300～500bp.
③点击OK，软件即开始自动搜索引物，搜索完成后，会自动跳出结果窗口，搜索结果默认按照评分（Rating）排序，点击其中任一个搜索结果，可以在“引物窗口”中，显示出该引物的综合情况，包括上游引物和下游引物的序列和位置，引物的各种信息等。
④对于引物的序列，可以简单查看一下，避免出现下列情况： 3’不要出现连续的3个碱基相连的情况，比如GGG或 CCC，否则容易引起错配。此窗口中需要着重查看的包括：Tm应该在55～70度之间，GC％应该在45％～55％间，上游引物和下游
Orthologs are genes in different species that evolved from a common ancestral gene by speciation; by contrast, paralogs are genes related by duplication within a genome.
W. M. Fitch, Distinguishing homologous from analogous proteins, Syst. Zool. 19, 99 (1970). PDF
This definition may not embrace all of the complexity of relationships between genes in different genomes. For example, if genes A and B are paralogs encoded in genome 1, and A9 and B9 are their respective orthologs
定义
　　基因组进化中，一个基因通过基因重复产生了两个或更多的拷贝，这些基因即构成一个基因家族。
　　是具有显著相似性的一组基因，编码相似的蛋白质产物。
　　在真核细胞中许多相关的基因常按功能成套组合，被称为基因家族（gene family）。同一家族中的成员有时紧密的排列在一起，成为一个基因簇；
　　更多的时候，它们却分散在同一染色体的不同部位，甚至位于不同染色体上，具有各自不同的表达调控模式。
　　一组功能相似且核苷酸序列具有同源性的基因，可能由某一共同祖先基因经重复和突变产生。
多基因家族
　　真核基因组的特点之一就是存在多基因家族（multi gene family）。多基因家族是指由某一祖先基因经过重复和变异所产生的一组 基因。多基因家族大致可分为两类：一类是基因家族成簇地分布在某一条染色体上，它们可同时发挥作用，合成某些蛋白质，如组蛋白基因家族就成簇地集中在第7 号染色体长臂3区2带到3区6带区域内；另一类是一个基因家族的不同成员成簇地分布不同染色体上，这些不同成员编码一组功能上紧密相关的蛋白质，如珠蛋白 基因家族。在多基因家族中，某些成员并不产生有功能的基因产物，这些基因称为假基因（pseudo gene）。假基因与有功能的基因同源，原来可能也是 有功能的基因，但由于缺失，倒位或点突变等，使
　
cat
chattr
chgrp
chmod
chown
cksum
cmp
diff
diffstat
file
find
git
gitview
indent
这个推荐给以后想做系统生物学的同学，大概是我这两年半的时间里，看过的一些文章的通讯作者。因为系统生物学本身暂时没有一个特别固定的研究套路，但是会有几个比较有前途的方向，list里面的这些人大都是系统生物学领域里提出过很多新方法和新想法的人，当然系统生物学并不是一个新的学科，只是系统生物学这个名词出现于1999年左右，因为目前深入到分子水平以后，生物系统的复杂性超出人们的想象。所以目前我们所说的系统生物学只是处于起始阶段，有很多人提出了很多种观点和研究方法，也有很多人风光一时，但是后来又被时代的马车抛弃了。
鉴于我水平有限，这个只是介绍一下我知道的一些实验室，大部分是通过读文章了解的，所以应该也比较有限，也许会涉及到一些Synthetic Biology的，不会太多。
Leroy Hood@ISB
此人就是第一个系统生物学研究所的所长，现在貌似做董事去了。。。Hood是比较早提出系统生物学概念的人，追求高通量技术。。。不过我认为这个太依赖于技术的发展了，看高通量技术何时能够高精度的quantitatively测量生物系统再说。。。Hood最近好像在搞microfluidic方面的东西，他很有商业头脑，diagnostic是一个利润非常大的领域，ISB站在前端。。。
类似的还有
----------------------------------------------------------------
*. 陈润生：是我国最早从事理论生物学和生物信息学研究的科研人员之一。二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究，曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌 B4基因组序列的组装和基因标识，曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。共发表学术论文100余篇，自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告十余次。陈教授写过大量的生物信息方面概述性的论文，算是我的启蒙老师吧。
http://www.ibp.ac.cn/c/faculty/02/runshengchen.html
*. 罗静初:北京大学生物信息中心教授，博士生导师，欧洲分子生物学网络组织中国节点负责人，英国Briefings in Bioinformatics杂志编委。1947年生，1970年毕业于北京大学生物系。1986年起从事DNA和蛋白质序列计算机分析。1987-89 赴美国马里兰大学进修访问，从事蛋白质分子模型和计算机在分子生物学中的应用研究。1991-99先后5次赴英国帝国癌症研究所合作研究，从事蛋白质分子模型、蛋白质结构域分析和数据库构建、蛋白质回环数据库构建等研究。1996年起主持和参加863、973、211、985，以及自
生物